Nintendo GameCube Bien que le manoir ait été détruit, la menace n’est pas enrayée. Il y a toujours des monstres en liberté qui rôdent dans la forêt de Raccoon, certains d'entre eux errant même jusqu'aux limites de la ville de Raccoon City. Les recherches d’ Umbrella continuent, malgré la perte du laboratoire du manoir. Tout change vers la fin septembre 1998 : après qu' Umbrella ait ordonné l’attaque contre William Birkin, montrée dans Biohazard 2, les rats d’égouts répandent le virus dans Raccoon City. Alors que l’épidémie démarre lentement, elle se propage très, très vite. Bientôt, les zombies infestent les rues. Des centaines, si ce n'est des milliers de personnes sont tuées par les zombies et les mutants créés par le Virus-T. Les choses tournent rapidement mal et la loi martiale est déclarée. La police de Raccoon City essaie de combattre l’invasion des zombies, mais leurs efforts sont sabotés par le Chef de Police, Brian Irons, perdant de plus en plus la raison. Non seulement il isole Raccoon des renforts venant de l’extérieur de la ville, mais en plus il jette délibérément la confusion entre les policiers. Ainsi le 27 septembre, la première bataille importante de la police contre les zombies tourne au désastre. Les quelques policiers survivants se réfugient dans le commissariat et se barricadent afin d'essayer de créer un siège de résistance contre les zombies. Durant les trois jours qui suivent, les policiers et les civils survivants meurent un par un, dévorés par les mutants, les zombies, ou tués par Irons lui-même. Au moment où Claire et Leon arrivent dans le commissariat, le 30 septembre, le département de police de Raccoon est réduit à deux personnes : Irons et Marvin Branagh, qui est mourant. Pendant que la police combat les zombies, deux hélicoptères affublés du logo d’ Umbrella atterrissent dans la ville, et déposent une petit nombre d’hommes armés, portant eux aussi le logo d’ Umbrella sur leurs vêtements. Ces hommes, pourtant mieux équipés que la police, perdent de nombreux compagnons d’armes dans leur première rencontre avec les zombies, et se retrouvent rapidement en fuite. Le 28 septembre, Raccoon City est une ville fantôme, peuplée par des zombies et autres créatures issues du Virus-T. Un blocus militaire encercle Raccoon City, appliquant la quarantaine. Aucune aide n'est prévue. Des milliers de personnes ont été exterminées. Sans que l'on sache comment, Jill Valentine est parvenue à survivre à tout cela..........